โครงสร้างทางสถาปัตยกรรมของระบบปฏิบัติการนั้น จะถูกแบ่งออกเป็น 2 โครงสร้างคือ แบบ 32 บิต (x86) ซึ่งเป็นโครงสร้างที่ถูกนำมาใช้งานมากที่สุดในปัจจุบัน (ส่วนใหญ่จะเป็นคอมพิวเตอร์สำหรับผู้ใช้งานทั่วไป) และแบบ 64 บิต (x64) ซึ่งเป็นโครงสร้างที่นิยมใช้ในองค์กรขนาดใหญ่เป็นหลัก
โดยความแตกต่างที่ชัดเจนมากที่สุดคือ การติดตั้งไดร์เวอร์, ซอฟต์แวร์ประยุกต์ และเรื่องของข้อจำกัดทางด้านฮาร์ดแวร์เช่น ไดร์เวอร์สำหรับฮาร์ดแวร์แบบ 32 บิต และ 64 บิต จะไม่สามารถนำมาใช้งานร่วมกันได้ หรือจำนวนการติดตั้งหน่วยความจำ (แรม) สำหรับ 64 บิตจะรับได้สูงสุดถึง 128GB (อาจจะเพิ่มได้มากขึ้นในอนาคต) ในขณะที่แบบ 32 บิต ในปัจจุบันสามารถติดตั้งแรมได้สูงสุดเพียง 8GB เท่านั้น
